基于结构域的芥子油苷合成相关蛋白质相互作用模型构建和预测1）

• 作者: 刘亚秋 初砚硕 孙晓芳
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 芥子油苷合成途径相关蛋白质 蛋白质相互作用 结构域-结构域相互作用
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 134-139
• 页数: 6页
• 分类号: Q946.1|TP181
• 语种: 中文

摘要

从蛋白质一级序列抽取蛋白质结构域信息建立结构域特征向量，使用结构域特征向量训练基于高斯径向基核的支撑向量机，用5折交叉验证对支撑向量机参数网格寻优，然后用最优化参数训练得到蛋白质相互作用预测器。结果表明：预测器的交叉验证ROC曲线下面积达到了85．49％，可以有效预测拟南芥相关的蛋白质相互作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘亚秋		55	259	9.0	13.0
2	孙晓芳		8	43	3.0	6.0
3	初砚硕		1	0	0.0	0.0