长柄石杉L-赖氨酸脱羧酶基因克隆及序列分析

• 作者: 宋育红 张君诚 陈作毅
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: L-赖氨酸脱羧酶 石杉科 基因克隆 序列分析 长柄石杉 闽浙马尾杉 华南马尾杉 有柄马尾杉
• 年，卷（期）: 2015,（21）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3228-3234
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.21.019

摘要

目的 在对长柄石杉Huperzia serrata、闽浙马尾杉Phlegariurus minchegensis、华南马尾杉Phlegariurus austrosinicus 和有柄马尾杉Phlegariurus petiolatus4种石杉科植物的L-赖氨酸脱羧酶(L-lysine decarboxylase,LDC)基因编码区进行克隆的基础上,对长柄石杉的LDC基因全长序列进行分析并预测其蛋白结构.方法 采用RT-PCR技术,以石杉科植物叶片提取的总RNA为模板克隆得到LDC基因编码区序列,通过BLAST比对和MEGA5.0软件对克隆的序列进行分析.采用RACE技术获得石杉科广布种长柄石杉的LDC基因全长序列,并对其蛋白的二级结构及三维结构进行预测分析.结果 克隆的4种石杉科植物LDC基因序列与数据库中被注释为编码LDC的基因序列保持高度的相似性,长柄石杉LDC蛋白与NCBI中的蛇足石杉LDC氨基酸序列相似度很高,与蕨类植物江南卷柏的同源性也较高.长柄石杉LDC基因编码区全长为1 266 bp,编码403个氨基酸,GenBank登录号KF040056.结论 克隆得到4种石杉科植物的LDC基因,分析了长柄石杉LDC基因的全长序列并预测其蛋白结构,为进一步阐明石杉科植物石杉碱甲生物合成途径奠定基础.