3种炭疽菌P型ATP酶基因家族分析

• 作者: 孙董董 李博勋 林春花 黄贵修
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 炭疽菌 P型ATP酶基因 生物信息 功能预测
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及防治
• 页码范围: 737-745
• 页数: 9页
• 分类号: S432.4
• 字数: 4185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.04.017

摘要

P型ATP酶是一类可以被ATP驱动其发生磷酸化的阳离子泵.利用TCDB (Transporter Classification Database)网站数据库中的P型ATP酶氨基酸序列对3种炭疽菌(禾谷炭疽、希金斯炭疽、胶孢炭疽)全基因组数据库进行搜索,结合结构域分析和进化树聚类分析,共找出候选P型ATP酶基因禾谷炭疽菌26个,希金斯炭疽菌37个,胶孢炭疽菌29个.对这些候选基因进行基因功能预测发现其主要参与转运Na+/K+、Ca2+、重金属离子以及磷脂的功能.利用MEME程序分析,从3种炭疽菌中均鉴定获得20个基序,其中有6个基序相同.这为深入研究炭疽菌P型ATP酶家族基因生物学功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙董董	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室	2	11	2.0	2.0
5	林春花	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室	12	100	7.0	9.0
6	李博勋	中国热带农业科学院环境与植物保护研究所海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室	7	28	3.0	5.0