茄科植物PAL基因家族的鉴定和序列分析

• 作者: 王鹏 盖江涛 陈振玺
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 苯丙氨酸解氨酶 PAL 基因家族 氨基酸 茄科
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 474-479
• 页数: 6页
• 分类号: Q949.777.7
• 字数: 3638字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.03.005

摘要

苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanine ammonia-lyase [EC:4.3.1.24])是植物次生代谢尤其是苯丙烷途径的关键酶,与植物抵抗病原菌入侵密切相关,具有重要的植物生理学意义;其催化产物是辣椒素等植物天然产物的前体.采用BLASTP方法,依托全基因组数据库,获得了番茄、马铃薯、本氏烟草、辣椒等4种茄科植物及杨树、拟南芥的PAL基因家族成员共27条序列,并对其进行初步的生物信息学分析、理化性质分析及结构分析.结果表明:在进化过程中,茄科植物烟草、番茄、马铃薯和辣椒的亲缘关系较近,拟南芥、杨树与茄科植物的亲缘关系较远;酸性蛋白质占96.3％,所有蛋白均为亲水性稳定蛋白、有明显跨膜现象、无信号肽;所有PAL亚细胞定位于细胞质中,具有活性位点的蛋白占96.3％.本研究结果为进一步研究茄科植物中PAL代谢机理提供理论支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王鹏	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	18	24	4.0	4.0
2	盖江涛	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	14	28	4.0	5.0
3	陈振玺	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	3	12	2.0	3.0