鹌鹑肠道微生物PCR-DGGE方法的优化

• 作者: 余冉 刘燕 张振华 王长永 鲍王波
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 鹌鹑 肠道微生物 总DNA提取 变性凝胶梯度电泳(DGGE)
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 73-78
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.01.011

摘要

通过对鹌鹑肠道微生物总DNA不同提取方法的效率进行比较，探讨DNA质量以及PCR-DGGE反应条件对研究鹌鹑肠道微生物多样性的影响。本试验利用常规的饱和苯酚/氯仿法和3种试剂盒（QIAGEN试剂盒、上海生工试剂盒、天根试剂盒）方法提取鹌鹑肠道微生物总DNA，分别以细菌V3可变区引物和V6-V8可变区引物以及不同退火温度进行PCR-DGGE分析。QIAGEN试剂盒法提取的肠道微生物总DNA的 A260/A280值在1.8-1.9之间，浓度约200 ng/μL，DGGE微生物多样性条带均匀度均高于其他3种提取方法。此外，利用不同引物扩增的DGGE图谱发现，以V6-V8可变区引物扩增的DGGE图谱条带均匀，分离充分，较V3可变区更能反映鹌鹑肠道微生物种群的多样性；同时，随PCR退火温度的升高，V6-V8可变区的微生物多样性指数下降， V3可变区的微生物多样性则无明显变化。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余冉	东南大学能源与环境学院	20	147	7.0	11.0
2	刘燕		13	57	5.0	7.0
3	王长永		7	30	3.0	5.0
4	张振华		7	33	3.0	5.0
5	鲍王波	东南大学能源与环境学院	2	8	2.0	2.0