四种小鼠肠道微生物DNA提取方法比较

• 作者: 吴敏娜 屈艳 武亚琦 钟根深 魏纪东
• 来源期刊: 生态学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA提取 肠道微生物 粪便 变性梯度凝胶电泳(DGGE)
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 所属期刊栏目: 方法与技术
• 页码范围: 1183-1188
• 分类号: Q939
• 语种: 中文

摘要

采用异硫氰酸胍(guandine thiocyanate,GITC)法、Tiangen DNA提取试剂盒、Omega DNA提取试剂盒和广泛应用的十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)法提取小鼠粪便微生物总DNA,通过比较所提取DNA的浓度和纯度,发现粪便DNA提取试剂盒提取的DNA纯度最高但浓度最低;CTAB法所得的DNA浓度最高但纯度最低;GITC法所得DNA的浓度高于粪便DNA提取试剂盒,纯度高于CTAB法.通过变性梯度凝胶电泳(16S rDNA-PCR-DGGE)指纹图谱分析技术进一步比较了各种提取方法所代表微生物群落的丰富度和多样性.结果表明,GITC法提取得到的DNA所代表细菌的丰富度和多样性显著高于其他3种方法.本实验所建立的GITC法可更全面地反映肠道微生物的多样性和群落结构,是一种较为理想的粪便微生物DNA提取方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏纪东	新乡医学院基础医学院	9	57	4.0	7.0
2	吴敏娜	新乡医学院基础医学院	10	25	3.0	4.0
3	武亚琦	新乡医学院基础医学院	2	10	2.0	2.0
4	屈艳	新乡医学院基础医学院	10	56	5.0	7.0
5	钟根深	新乡医学院基础医学院	6	18	3.0	4.0