菜心种质资源遗传多样性的SCoT分析

• 作者: 史卫东 康红卫 张力 熊发前 琚茜茜 罗海玲
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 菜心 遗传多样性 SCoT 聚类分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子生物学
• 页码范围: 1350-1355
• 页数: 6页
• 分类号: S634.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2015.08.1350

摘要

[目的]利用SCoT标记分析菜心种质资源的遗传多样性,为其分类和利用提供理论依据.[方法]搜集熟期和株色各异的33份菜心种质资源,利用筛选的12条SCoT引物对其进行遗传多样性分析.[结果]12条引物从33份菜心共扩增出83条带,引物多态性百分率变化范围为2.63％～57.89％,平均多态性百分率为36.00％;每条引物多态性条带变化范围为4～9条,平均3.4条;扩增片段大小为500～1500 bp.观察等位基因数(Na)为1.065,有效等位基因数(Ne)为1.254,Shannon's信息多样性指数(Ⅰ)为0.217,期望杂合度(He)为0.149,平均Nei's遗传距离为0.428.AMOVA分析发现,81％的变异来源于品种内,19％的变异来源于品种间.聚类分析结果表明,在Nei's遗传距离0.24处可将33份菜心分成两大类,第一类包括14个早熟品种、2个中熟和1个晚熟品种;第二类包括10个中晚熟品种和6个早熟品种.[结论]SCoT标记的分类结果与熟期分类结果较一致,多数菜心品种可根据熟期和SCoT标记归类;SCoT标记具有操作简单、重复性高、多态性较丰富等优点,可用于菜心遗传多样性研究的初步批量检测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	史卫东	广西农业科学院蔬菜研究所	8	28	4.0	5.0
5	琚茜茜	广西农业科学院蔬菜研究所	5	6	2.0	2.0
6	张力	广西农业科学院蔬菜研究所	8	16	3.0	4.0
7	罗海玲	广西农业科学院蔬菜研究所	22	198	8.0	13.0
8	熊发前	广西农业科学院经济作物研究所	17	39	4.0	5.0
9	康红卫	广西农业科学院蔬菜研究所	22	75	4.0	7.0