卵巢癌对顺铂类药物耐药性的相关分析

• 作者: 张玉琪 汪涛 邢丽
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 顺铂 卵巢肿瘤 计算生物学 逆转录聚合酶链反应 qRT-PCR A2780 A2780/DDP
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 细胞与分子生物学
• 页码范围: 1108-1111
• 页数: 4页
• 分类号: R737.31
• 语种: 中文
• DOI: 10.11958/j.issn.0253-9896.2015.10.006

摘要

目的：筛选影响卵巢癌顺铂耐药性的靶点基因。方法从GEO数据库中下载对顺铂敏感和产生抗药性的人类卵巢癌细胞基因表达谱和甲基化谱数据（GSE15709），利用R的相关工具包筛选A2780和A2780/DDP（顺铂耐药卵巢癌细胞系）两类卵巢癌细胞之间的差异表达和差异甲基化的基因；使用DAVID数据库对差异表达基因进行功能富集分析；对同时发生了差异甲基化、差异表达且甲基化水平、表达水平的变化趋势相反的基因，进一步利用qRT-PCR技术检测这些基因在两种卵巢癌细胞中的表达值。结果研究发现在两种卵巢癌细胞之间发生了416个差异表达和281个差异甲基化的基因，这些差异表达基因主要富集于细胞周期、核分裂和蛋白修饰负调控等生物过程。此外，细胞周期、DNA复制和p53等通路在这些基因中同样富集。共发现4个发生了差异甲基化、差异表达且甲基化变化水平、表达水平变化趋势相反的基因，qRT-PCR实验验证了这些基因在两种卵巢癌细胞中的表达水平。结论利用生物信息学和分子生物学相结合的方法，可以筛选出部分影响卵巢癌对顺铂抗药性的基因，为进一步揭示其中的分子机制提供实验参考。