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摘要:
目的:应用miRNA表达谱芯片筛选视网膜色素上皮细胞与氧化应激相关的miRNA,为更加全面深入地研究年龄相关性黄斑病变( age-related macular degeneration,AMD)发生的分子机制提供新的思路。<br>  方法:培养 D407细胞,分别使用100、200、400μmol/L H2 O2处理细胞24h后,Trizol试剂抽提细胞总RNA,使用Exiqon miRCURY LNATM microRNA表达谱芯片( miRBase 16.0数据库)检测不同浓度处理后D407细胞miRNA的表达差异,并将不同浓度处理后的变化进行聚类分析。使用Stem loop realtime PCR对芯片结果进行验证,并运用生物信息学方法预测差异miRNA调控的靶基因。<br>  结果:芯片所包含的1425个已知miRNA中,共有367个在不同浓度H2 O2处理后表达发生变化。通过Treeview软件进行聚类分析发现miR-31等17个miRNA随H2 O2浓度的升高呈现逐渐降低的趋势,miR-206等7个则逐渐升高。 PCR验证显示芯片结果准确性较好。<br>  结论:H2 O2作用前后RPE的miRNA表达存在明显差异, miRNA作为转录后水平的调节分子,参与了细胞氧化应激反应,可能在AMD的发生发展中起有重要作用。
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内容分析
关键词云
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文献信息
篇名 视网膜色素上皮细胞氧化应激相关microRNA的鉴定
来源期刊 国际眼科杂志 学科
关键词 氧化应激 视网膜色素上皮细胞 miRNA 年龄相关性黄斑变性
年,卷(期) 2015,(9) 所属期刊栏目 誗实验研究誗
研究方向 页码范围 1521-1524
页数 4页 分类号
字数 2951字 语种 中文
DOI 10.3980/j.issn.1672-5123.2015.9.07
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 冯海晓 西安交通大学第二附属医院眼科 32 124 6.0 9.0
2 陈凌 西安交通大学第二附属医院眼科 8 93 4.0 8.0
3 姚亮 西安交通大学第二附属医院眼科 13 25 3.0 4.0
4 柏凌 西安交通大学第二附属医院眼科 15 48 4.0 5.0
5 何玲 西安交通大学第二附属医院眼科 2 9 2.0 2.0
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研究主题发展历程
节点文献
氧化应激
视网膜色素上皮细胞
miRNA
年龄相关性黄斑变性
研究起点
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国际眼科杂志
月刊
1672-5123
61-1419/R
大16开
西安友谊东路269号
52-239
2000
chi
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