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青天葵1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因片段的鉴定和分析
青天葵1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因片段的鉴定和分析
作者:
何瑞
詹若挺
黄琼林
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
青天葵
1-脱氧-D-木酮糖-5磷酸合成酶
生物信息学
表达量
摘要:
1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类MEP生物合成途径的第一个限速关键酶,提高其编码基因的表达可提高植物萜类化合物的含量.该研究在青天葵全转录组测序数据中获取青天葵DXS基因片段序列,利用生物信息学方法对其系统发育进化、保守功能域、理化性质、亲/疏水性、跨膜结构域、信号肽等进行分析和预测,并采用RPKM法分析其在青天葵叶片和球茎的表达量,为后期利用DXS基因调控青天葵萜类成分的生物合成提供理论依据.结果表明:NfDXS基因片段序列长度为2 154 bp,编码含有718个氨基酸、分子量约为77.45 kDa的亲水性蛋白,与其它DXS同源性可达80%.NfDXS具有1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶功能域,没有信号肽和跨膜结构域,二级结构表现为混合型结构蛋白质.NfDXS基因在青天葵中的表达趋势为:叶片>球茎.
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内容分析
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文献信息
篇名
青天葵1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因片段的鉴定和分析
来源期刊
北方园艺
学科
生物学
关键词
青天葵
1-脱氧-D-木酮糖-5磷酸合成酶
生物信息学
表达量
年,卷(期)
2015,(22)
所属期刊栏目
生物技术
研究方向
页码范围
114-117
页数
分类号
Q946
字数
语种
中文
DOI
10.11937/bfyy.201522030
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
何瑞
广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室
32
139
6.0
11.0
2
詹若挺
广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心岭南中药资源教育部重点实验室
94
538
12.0
19.0
3
黄琼林
9
51
5.0
6.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
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共引文献
(167)
参考文献
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节点文献
引证文献
(4)
同被引文献
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1987(1)
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二级引证文献(1)
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研究主题发展历程
节点文献
青天葵
1-脱氧-D-木酮糖-5磷酸合成酶
生物信息学
表达量
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研究去脉
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期刊影响力
北方园艺
主办单位:
黑龙江省农业科学院
黑龙江省园艺学会
黑龙江省农业科学院编辑出版中心
出版周期:
半月刊
ISSN:
1001-0009
CN:
23-1247/S
开本:
大16开
出版地:
黑龙江省哈尔滨市南岗区学府路368号省农科院
邮发代号:
14-150
创刊时间:
1977
语种:
chi
出版文献量(篇)
21038
总下载数(次)
74
总被引数(次)
103850
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