红花栝楼鲨烯合酶基因的克隆及其序列分析

• 作者: 吴耀生 周青鸟 晁耐霞 罗育 苏荷玲 陶晨陈 马成通
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 红花栝楼 鲨烯合酶 RACE 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1034-1041
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.07.018

摘要

目的 克隆红花栝楼鲨烯合酶(squalene synthase,SS)的基因并进行序列分析,为进一步研究葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析奠定基础.方法 根据绞股蓝与罗汉果SS基因cDNA比对分析的结果,设计SS的5'端简并引物,采用3'RACE扩增红花栝楼SS全长cDNA基因.结果 获得红花栝楼SS cDNA全长共1 466个核苷酸,其中包括一个含有1 254个核苷酸的开放读码框,编码417个氨基酸残基.通过NCBI的Blast比对,发现红花栝楼SS基因编码的氨基酸序列与已知植物SS基因编码的氨基酸序列同源性为78％～94％,核苷酸的同源性为74％～93％.结论 成功克隆了红花栝楼SS的全长cDNA,为进一步研究红花栝楼SS基因结构、基因表达、基因突变提供了基础,并为葫芦科植物三萜合成通路关键酶SS的正选择位点与功能的关联性分析提供了数据支持.