接骨草HMGR基因cDNA克隆、不同器官中的差异表达及生物信息学分析

• 作者: 刘宇 姚元枝 郭文博 魏麟 黎晓英
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 接骨草 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶 实时荧光定量PCR cDNA序列 萜类化合物
• 年，卷（期）: 2015,（16）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2449-2453
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2015.16.019

摘要

目的 克隆接骨草Sambucus chinensis3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因并分析其差异表达.方法 采用RT-PCR方法获得HMGR基因cDNA序列,并对HMGR蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三级结构预测分析,并预测该蛋白功能;利用实时荧光定量PCR方法检测HMGR基因在接骨草的根状茎、地上茎、叶、花中的表达情况.结果 克隆获得的HMGR基因cDNA全长为1 626 bp,编码593个氨基酸.生物信息学预测HMGR蛋白含2个跨膜区,不含信号肽.HMGR基因主要在接骨草的花和地上茎中表达较高,其他器官表达相对较低.结论 首次从接骨草中克隆了HMGR基因,为进一步阐明该基因在接骨草萜类化合物代谢途径中的重要作用奠定基础.