新疆野扁桃自交不亲和基因SSK1的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘梦雯 夏江宏 曾斌 李伟阳 李疆 田嘉 阿卜都赛麦提·艾则孜
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 新疆野扁桃 自交不亲和 PetSSK1基因 克隆
• 年，卷（期）: 2015,（25）
• 所属期刊栏目: 林学·园艺
• 页码范围: 107-112
• 分类号: S662.9
• 语种: 中文

摘要

为了获得新疆野扁桃居群中自交不亲和花粉特异性表达的SSK1基因全长,以新疆野扁桃植物叶片及花粉为试验材料通过rt-PCR技术以及生物测序等技术,克隆得到了一个新的SSK1基因全长cDNA,PetSSK1.PetSSK1全长为602 bp,开放阅读框为534 bp,共编码了177个氨基酸,经生物信息学分析,PetSSK1蛋白的分子式为C910H1421N233O295S6,相对分子质量为20538.0,理论推导半衰期为30 h,等电点为4.52,不稳定指数为41.48,平均疏水指数为-0.567,PetSSK1蛋白属于水溶性不稳定蛋白.首次从新疆野扁桃植株中克隆得到了SSK1基因全长.通过对该基因的克隆及序列分析,为今后的表达分析以及有效利用该基因获得自交亲和植株奠定了基础.