南海北部巴士海峡深海沉积物中几丁质酶基因多样性分析

• 作者: 向文洲 吴华莲 戴世鲲 李涛 王广华
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 南海 深海沉积物 几丁质酶
• 年，卷（期）: 2015,（13）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 140-145
• 页数: 6页
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 3088字
• 语种: 中文

摘要

海洋微生物是新颖几丁质酶基因的重要来源.构建南海北部巴士海峡深海表层沉积物几丁质酶基因文库,得到几丁质酶氨基酸序列共计114条.以0.3的距离划分OTU,得到54个OTU单元,丰富度指数Chao1值为159.86,多样性指数Shannon和Simpson值分别为3.39和0.06.对54条OTU单元的代表序列,利用BLAST程序与GenBank基因库中的序列比对,所有序列均发现具有几丁质酶基因的保守位点,相似性最高为97％,最低为41％,31个OTU单元的代表序列来自于未培养微生物.结果表明,在南海北部深海沉积环境中具有丰富的几丁质酶基因多样性,蕴藏着大量未知的几丁质酶基因资源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	向文洲	中国科学院南海海洋研究所/中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室	33	396	12.0	19.0