加工番茄PCR-SSCP分子标记体系的建立与优化

• 作者: 庞胜群 汪斌 程琳琳 闫丽娟 马海新 魏海滨
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 加工番茄 PCR-SSCP 聚丙烯酰胺凝胶 银染
• 年，卷（期）: 2015,（15）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 88-93
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.201515024

摘要

以加工番茄为试验材料,采用PCR-SSCP分子标记技术,对DNA提取方法、PCR反应程序、聚合酶链式反应-单链构象多态性分子标记体系的电泳条件、变性剂等诸多因素进行了研究,筛选和建立了多态性检出率高、带型清晰、重复性好的PCR-SSCP反应体系和反应程序.结果表明:采用CTAB法提取番茄叶片DNA时,在CTAB缓冲液中加入5 mol/L NaC1,第一次抽提离心速度和离心时间分别为8 000 r/min和15 min,可以获得高质量的DNA,PCR扩增程序为94℃5 min,94℃ 1min,52℃30 s,72℃1min,72℃10 min,29个循环,退火温度52℃,引物大小100～300 bp、98℃变性10 min,非变性聚丙烯酰胺凝胶浓度8％,电泳1.5～2.5 h,聚丙烯酰胺凝胶中不添加甘油为加工番茄PCR-SSCP分子标记体系最佳的条件组合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	庞胜群	石河子大学农学院	28	132	7.0	10.0
2	魏海滨	石河子大学农学院	2	10	1.0	2.0
3	马海新	石河子大学农学院	6	30	3.0	5.0
4	闫丽娟	石河子大学农学院	4	20	1.0	4.0
5	汪斌	石河子大学农学院	4	20	1.0	4.0
6	程琳琳	石河子大学农学院	1	0	0.0	0.0