上海地区水稻已知品种SSR指纹图谱库构建

• 作者: 杨华 褚云霞 邓姗 陈海荣 顾可飞 黄志城
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: DNA指纹图谱 SSR分子标记 水稻 上海
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 农学·农业基础科学
• 页码范围: 7-15
• 分类号: S511
• 语种: 中文

摘要

用24对引物构建上海地区53份水稻品种的DNA指纹图谱,为当地水稻新品种保护、遗传资源评价及亲缘关系分析提供理论依据和技术支持.结果显示,试验中共检测出109条多态性片段,变幅2～9条,平均每对引物4.5417条多态性片段,有效等位基因数为70.8187,平均每个标记2.9508个;Shannon多 样性指数(Ⅰ)平均值为1.1296,变幅0.4949～1.8402;多态性信息含量(PIC)平均值为0.5415,变幅0.2656～0.8001.用24个标记建立53份材料的DNA指纹图谱,这些字符串就构成了这53份材料的“身份证号码”,本试验中,各材料的分子身份证号码是唯一的;聚类分析表明,在遗传相似系数0.21处可以将53份材料分为2个类群,分别为粳稻组和籼稻组,但是组内遗传距离较近.由此可见,上海地区水稻品种的遗传多样性相对狭窄.