激素性股骨头坏死患者血浆 microRNA表达谱及生物信息分析

• 作者: 孙楠 曾建春 曾意荣 李鹏飞 樊粤光
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 股骨头坏死 糖皮质激素 微小RNA 基因表达谱
• 年，卷（期）: 2015,（48）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: R681.8
• 字数: 3431字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2015.48.001

摘要

目的：分析激素性股骨头坏死（ SONFH）患者血浆microRNA表达谱变化及生物信息内容，并探讨其意义。方法选取SONFH患者（观察组）和健康志愿者（对照组）各6例，采用Real-time PCR法检测其血浆microR-NA相对表达量，筛选差异表达的microRNA。采用TargetScan、mirBase及miRanda三个在线数据库预测交集靶基因，分别进行功能富集性分析和信号转导通路富集（Pathway）分析。结果共检测768个microRNA，两组差异表达的microRNA 16个，其中观察组上调10个，比较明显的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887（观察组／对照组＞3）；下调6个，比较明显的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p（观察组／对照组＜0．5）。三个在线数据库共筛选出交集靶基因887个，其中上调microRNA 483个，hsa-miR-1207-5p未检出交集靶基因，hsa-miR-887检出交集靶基因为GSK3A和CASK；下调microRNA 404个，hsa-miR-96-5p检出交集靶基因114个，hsa-miR-576-5p检出59个。功能富集性分析显示，两组差异表达microRNA调控的靶基因功能主要包括解剖结构形态、间充质细胞增殖、细胞代谢过程等， Pathway分析显示靶基因明显富集于各种信号通路。结论 SONFH患者血浆microRNA 明显上调的是hsa-miR-1207-5p和hsa-miR-887，明显下调的是hsa-miR-96-5p、hsa-miR-576-5p，microRNA异常表达可能通过各信号通路参与SONFH的发病。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	樊粤光		117	1563	23.0	36.0
2	曾意荣		78	700	13.0	25.0
3	李鹏飞		24	100	7.0	8.0
4	孙楠		2	15	2.0	2.0
5	曾建春		34	249	7.0	15.0