黄瓜疫霉菌ITS及β-tubulin的扩增和序列分析

• 作者: 丁婧 吴晓金 易图永 雷颖
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 黄瓜疫霉菌 遗传多样性 系统发育树 ITS β-tubulin 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（32）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 48-53
• 分类号: Q7
• 语种: 中文

摘要

摘荽:为研究不同来源地黄瓜疫霉菌的系统发育关系以及遗传多样性,从湖南省内5个黄瓜种植区采集具有典型症状的黄瓜疫病病株分离纯化,利用形态学方法观察孢子囊形态.再运用PCR技术分别进行ITS以及β-tubulin扩增测序并与Genbank的中相关序列构建系统发育树.经形态学初步鉴定22株黄瓜疫霉菌株,ITS-PCR序列长度约为780 bp,β-tubulin-PCR序列长度约为800 bp,所有测得序列与下载自Genbank的相关序列存在不同程度的相似性.ITS序列的系统发育分析,用于构建系统发育树的序列分为.2个大的聚类Ⅰ和Ⅱ,黄瓜疫霉菌均位于Ⅰ组内,由于来源地差异,不同地区的黄瓜疫霉菌又被聚在不同小类;β-tubulin序列在系统发育分析中被分为4个聚类,22个P.melonis序列与下载的P.melonis序列均在聚类组Ⅰ中.聚类分析结果表明:疫霉属种群间具有明显的亲缘关系,不同地域的黄瓜疫霉菌遗传多样性表现出差异,但总体趋势是相同来源地的菌株亲缘性比较接近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	易图永	湖南农业大学植物保护学院	91	1047	18.0	30.0
10	丁婧	湖南农业大学植物保护学院	1	1	1.0	1.0
11	雷颖	湖南农业大学植物保护学院	2	7	1.0	2.0