野巴旦杏AlsCBF基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘立强 李宁 李疆 罗淑萍
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 野巴旦杏 AlsCBF 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（32）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 54-61
• 分类号: Q81
• 语种: 中文

摘要

对克隆获得的野巴旦杏基因ASCBF进行生物信息学分析,从而为该基因的功能鉴定提供理论基础,以期为新疆巴旦杏的抗寒育种提供基因来源.通过采用RT-PCR和RACE方法从野巴旦杏中克隆到植物抗逆途径关键转录因子CBF基因全长并命名为AlsCBF,GenBatk登录号为HQ908653.生物信息学分析表明:该基因全长1171 bp,其中编码区长714 bp,编码237个氨基酸,其蛋白的分子式为C1156H1832N332O356S15,相对分子质量为26.5581 kDa,理论等电点为6.76,该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主.肽链可能含有8处丝氨酸磷酸化位点,1处苏氨酸磷酸化位点.三维结构预测表明其符合AP2结构域模型特点.本研究通过对AbCBF基因的生物信息学分析,获得了该基因的相关信息,并与已有研究结果进行比对分析,推测该基因在植物抗寒过程中有重要的作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李疆		209	2704	28.0	40.0
2	李宁		52	341	10.0	17.0
6	罗淑萍		152	1655	22.0	30.0
7	刘立强		40	331	10.0	17.0