利用表达谱基因芯片筛选溃疡性结肠炎差异表达基因

• 作者: 余鹏飞 吴开春 徐斌 沙素梅 白槟 郭长存 魏妮
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 溃疡性结肠炎 基因表达谱芯片 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 53-57
• 分类号: R574.62
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2015.01.012

摘要

目的:利用人类全基因组表达谱芯片技术,分析溃疡性结肠炎患者和健康者基因表达谱差异,筛选出溃疡性结肠炎相关基因.方法:采用Trizol法提取8例溃疡性结肠炎患者和8例健康对照者结肠粘膜组织总RNA并纯化,逆转录合成cDNA,利用荧光染料Cy3标记aaUTP,转录合成标记的cRNA,并与Agilent人类全基因组表达谱芯片杂交,扫描荧光信号图像,对芯片原始数据进行归一化处理,利用倍数差异和t检验计算筛选出相关差异表达基因,采用DAVID在线分析系统进行基因的功能注释和关联分析,明确差异基因的生物学功能,并对部分差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证.结果:筛查出溃疡性结肠炎结肠粘膜组织差异表达基因4132个,其中上调基因2004个,下调基因2128个.选取6条差异表达基因进行PCR验证,结果有3条基因表达上调,3条基因表达下调,表达趋势与芯片结果一致.结论:溃疡性结肠炎患者与健康对照者基因表达存在明显差异,分析这些差异表达基因有助于我们探索溃疡性结肠炎的发病机制,为疾病的治疗提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴开春		154	1004	16.0	23.0
2	郭长存		15	90	5.0	8.0
3	沙素梅		10	133	6.0	10.0
4	魏妮		1	7	1.0	1.0
5	徐斌		11	41	4.0	6.0
6	白槟		7	31	3.0	5.0
7	余鹏飞		7	32	3.0	5.0