幽门螺杆菌感染相关胃癌的差异蛋白分析

• 作者: 刘爱群 王江燕 葛莲英 袁燕玲 陈佳玮
• 来源期刊: 中华实验外科杂志
• 关键词: 胃肿瘤 幽门螺杆菌 蛋白质组学 核素标记相对和绝对定量
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1339-1342
• 页数: 4页
• 字数: 2719字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1001-9030.2015.06.044

摘要

目的 利用核素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术筛选幽门螺杆菌(Hp)感染相关胃癌的差异蛋白,以便寻找胃癌的生物学标志物和药物治疗靶标.方法 分别收集人胃癌细胞HGC-27及与Hp共培养24h的HGC-27的各组蛋白,iTRAQ试剂标记后利用强离子交换柱(SCX)分离,经串联质谱鉴定及相对定量;同时通过查阅Pubmed数据库中1995年1月至2014年7月公开发表的文献,其中使用任一种差异蛋白质组学方法鉴定Hp感染相关胃癌的差异蛋白;将iTRAQ数据与文献报道数据进行荟萃分析,对获得的差异蛋白采用PANTHER数据库进行基因功能聚类(GO)分析、PANTHER蛋白分类及路径(Pathway)分析.结果 通过iTRAQ标记鉴定出Hp感染相关胃癌细胞HGC-27的差异蛋白共47个,其中下调表达的37个,上调表达的10个.通过文献检索共纳入符合要求的文献7篇,其中2个以上实验室(包括iTRAQ实验)重复发现的蛋白为21个.将iTRAQ数据与文献报道数据荟萃分析得到65个差异蛋白,进行GO分析显示,生物学过程主要集中在细胞组分重组和各种代谢过程;分子功能主要集中在核酸、DNA结合,具有催化活性和转移酶活性;PANTHER蛋白分类主要为分子伴侣、结合蛋白、骨架蛋白、转氨酶和转录因子;Pathway分析显示差异蛋白主要参与帕金森疾病通路、凋亡信号通路和促性腺激素释放激素(GnRH)通路.结论 筛选出多种与Hp感染相关胃癌的差异蛋白,为胃癌患者的早期诊断提供可能的生物学标志物和药物治疗的靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	葛莲英	广西医科大学附属肿瘤医院内镜室	78	378	9.0	14.0
2	刘爱群	广西医科大学附属肿瘤医院内镜室	54	281	10.0	12.0
3	王江燕	广西医科大学附属肿瘤医院肿瘤实验研究部	2	5	1.0	2.0
4	陈佳玮	广西医科大学附属肿瘤医院内镜室	1	5	1.0	1.0
5	袁燕玲	广西医科大学附属肿瘤医院内镜室	3	15	3.0	3.0