高粱SSR和EST-SSR标记在割手密中的通用性分析

• 作者: 刘洋 姚艳丽 徐磊 胡小文 邢淑莲
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 高粱 通用性 SSR EST-SSR 割手密
• 年，卷（期）: 2015,（27）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 164-171
• 分类号: S566.1
• 语种: 中文

摘要

目前,割手密中开发的分子标记有限,为增加其分子标记数量,本研究对高粱分子标记在割手密中的通用性进行分析.选用高粱的29对基因组SSR标记和20对EST-SSR标记在割手密种质GSM39中进行筛选,以评价其通用性.进一步利用14份割手密材料评价标记的多态性和遗传多样性.结果显示:70％的EST-SSR引物在割手密中得到成功扩增,可用的EST-SSR引物中多态性比率占50％.SSR引物在割手密中的通用性比率只有34.5％,但多态性比率为70％.14对多态性引物在14份割手密中共检测到33个等位基因,平均观测等位基因数为2.4286,平均有效等位基因数为1.7,平均观测表观杂合度为0.544,平均期望杂合度为0.3858,Nei's基因多样性指数平均值为0.3716.结果表明,EST-SSR引物的通用性高于SSR引物,但SSR引物的多态性更高.这对割手密遗传多样性研究和比较基因组学研究具有重要意义.