NanoString nCounter分析系统进行多基因表达计数的评价

• 作者: 刘卓 吴建新 唐认桥 李媛媛 欧阳胜荣 赵欣
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: NanoString nCounter 多基因表达计数 评价
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 413-416
• 分类号: R-331
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2015.03.003

摘要

目的:NanoString nCounter是近年发展起来的进行基因表达谱检测的新平台,它利用分子条形码直接对基因表达进行多重计数.本实验通过对mRNA表达量的检测,分析nCounter系统进行基因表达计数的可靠性.方法:应用NanoString公司提供的CAE Kit试剂盒,通过杂交(mRNA样品与报告探针和捕获探针杂交)、纯化(清洗未结合探针)和计数(读取mRNA的条数)三个步骤,检测由人参考RNA和人脑RNA构成的4个样品中48个目的基因的mRNA表达量;对获得的未进行标准化的原始数据,应用Excel 2007软件进行线性分析,从再现性、稳定性、准确性方面对nCounter分析系统进行评估.结果:再现性分析所有R2均大于0.998,线性拟合良好;试剂盒中阳性控制所有R2均大于0.99,高于质控要求的0.95;样品H70B30和H30B70的预期表达量与实测值线性R2大于0.999,预期值与实测值一致性良好.结论:nCounter分析系统稳定性好,准确性高,检测mRNA表达可靠.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴建新		64	571	12.0	21.0
2	李媛媛		22	134	5.0	11.0
3	欧阳胜荣		13	51	4.0	7.0
4	唐认桥		3	3	1.0	1.0
8	赵欣		45	190	8.0	13.0
9	刘卓		16	80	5.0	8.0