芒果CHI基因的克隆及其表达分析研究

• 作者: 党志国 罗睿雄 罗石荣 赵志常 陈业渊 高爱平 麦贤家 黄建峰
• 来源期刊: 现代农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 芒果 CHI 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 园艺学 -- 园艺研究
• 页码范围: 84-86
• 页数: 3页
• 分类号: S667.7
• 字数: 3948字
• 语种: 中文

摘要

采用RT-PCR和RACE方法从芒果的果实中克隆得到了一个参与花色素苷生物合成的查尔酮异构酶基因(CHI)的全长的cDNA序列，进而对得到的序列采用了TMHMM、DNAman等软件进行生物信息学分析，发现芒果CHI基因包含编码区、3'和5'非翻译区的长度为960 bp的cDNA序列，开放阅读框为753 bp，编码250个氨基酸；等电点为6.46，分子重量为27.03 Kd；对跨膜结构域进行了预测发现，该基因无跨膜结构域；蛋白二级结构元件以无规则卷曲和β-折叠为主；聚类分析发现：该基因与美洲葡萄、葡萄、龙眼和橄榄等植物的亲缘关系较近，而与拟南芥、萝卜、文心兰等亲缘关系较远；分别对红色和绿色的叶片分析发现：该基因主要在红色叶片中表达量比较高。