虚拟实验室技术评价recA标准序列比对法对洋葱伯克霍尔德菌复合体种别鉴定效果

• 作者: 倪晓平 孔庆鑫 徐虹 沈林海 陈冰冰 韦凌娅
• 来源期刊: 中国卫生检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 虚拟实验室 洋葱伯克霍尔德菌复合体 recA标准序列比对法 MSLT法
• 年，卷（期）: 2015,（18）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 3025-3028,3034
• 页数: 5页
• 分类号: R446.1
• 语种: 中文

摘要

目的 利用虚拟实验室技术评价recA标准序列比对(ARRS)法,对洋葱伯克霍尔德菌复合体(Bcc)种别鉴定效果.方法 通过对GenBank、MLST数据库等公共数据库内相关信息进行核实和分析,筛选出在GenBank、MLST 2个数据库中均存在详实的recA基因及MLST分型信息的Bcc菌株作为目标菌株.根据目标菌株的recA基因序列信息,采用ARRS法对其进行鉴定.鉴定结果与MSLT数据库中该菌株分型鉴定结果进行比较.以MSLT法作为Bcc菌株鉴定的标准方法,计算ARRS法的灵敏度、特异度等相关统计学指标,评估其对Bcc菌株种别鉴定的效果.结果 ARRS法和MSLT法对93株目标菌株的鉴定结果显示,92株鉴定结果一致.相对于MSLT法,ARRS法灵敏度为98.9％,特异度为100.0％;2种方法一致性为98.9％ (P ＜0.01).结论 ARRS法对于鉴定Bcc内菌株具有较好的效果,可以满足临床筛检、医院感染流行病学调查等需求.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔庆鑫		42	300	8.0	16.0
2	沈林海		23	76	5.0	7.0
3	徐虹		44	320	10.0	15.0
4	韦凌娅		35	125	6.0	9.0
5	倪晓平		76	557	12.0	19.0
6	陈冰冰		11	26	4.0	4.0