基因结构分析软件对实时定量PCR引物进行设计和筛选

• 作者: 张进禄 方霄 杨颖 赵君朋 赵焕英
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 基因结构 引物 实时定量PCR
• 年，卷（期）: 2015,（36）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 7190-7193
• 分类号: Q81
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2015.36.052

摘要

目的:以人丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)基因结构为例,利用不同生物相关软件分析、设计和筛选合适的定量PCR引物.方法:利用NCBI的Gene数据库查找人MAPK3基因的参考序列、UniGene数据库查找标准参考序列;并用在线软件如Spidey,UCSC,Ensembl等分析基因结构;利用Primer3,Oligo6,IDT等软件进行引物设计;用MFOLD程序分析基因二级结构后,选择引物可定位的外显子位置;利用电子PCR进行引物扩增特异性的检验;最后通过实验检验引物的扩增效果.结果:从程序软件推荐的引物列表中筛选出一对能特异扩增人MAPK3基因的引物.结论:基因结构分析软件有助于定量PCR引物的设计.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张进禄	首都医科大学医学实验与测试中心	45	131	6.0	9.0
2	赵焕英	首都医科大学医学实验与测试中心	55	178	7.0	11.0
3	赵君朋	首都医科大学医学实验与测试中心	20	21	3.0	3.0
4	杨颖	首都医科大学医学实验与测试中心	11	22	2.0	4.0
5	方霄	济宁医学院药学院	1	0	0.0	0.0