碱蓬PEAMT基因的克隆及表达分析

• 作者: 傅旭军 朱丹华 杨清华 董德坤 袁凤杰 郁晓敏 金杭霞
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 碱蓬 SgPEAMT基因 荧光定量PCR 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 178-183
• 分类号: Q943.2
• 语种: 中文

摘要

研究旨在克隆碱蓬的耐逆相关基因——磷酸乙醇胺甲基转移酶(phosphoethanolamine N-methyltransferase,PEAMT)的编码基因,分析PEAMT基因调控机制,为进一步研究PEAMT基因的功能和碱蓬的耐盐机制奠定分子基础.依据GenBank数据库发表的其他物种的PEAMT序列设计简并引物,通过降落PCR法获得碱蓬PEAMT基因全长cDNA,命名为SgPEAMT,生物信息学软件分析其序列特点,荧光定量PCR检测其表达特性.序列分析表明SgPEAMT基因开放阅读框为1485 bp,编码494个氨基酸,推测其为亲水性蛋白.保守结构域分析表明,SgPEAMT含有2个独立的S-腺苷甲硫氨酸依赖性甲基转移酶的保守结构域,每个结构域含有4个基序.系统进化树分析确认SgPEAMT与同属的碱蓬属植物亲缘关系最近.实时荧光定量PCR分析显示,盐胁迫或ABA胁迫下碱蓬根、茎、叶中SgPEAMT基因的表达上调,特别是叶中表达量最高.研究结果表明,SgPEAMT基因受NaCl和ABA诱导表达,预示SgPEAMT基因可能在碱蓬对盐胁迫的反应中起重要作用,是一种参与碱蓬耐盐反应的有效耐逆基因,为植物基因工程提供有效的耐逆基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	傅旭军	浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所	29	92	5.0	8.0
2	袁凤杰	浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所	31	162	7.0	12.0
3	董德坤	浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所	23	92	6.0	8.0
4	杨清华	浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所	17	53	4.0	6.0
5	郁晓敏	浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所	22	57	4.0	6.0
6	金杭霞	浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所	10	20	2.0	4.0