芒属植物叶绿体InDel标记的开发与应用

• 作者: 丁力 彭思佳 易自力 肖亮 蒋建雄 薛宏
• 来源期刊: 现代农业科技
• 学科: 生物学
• 关键词: 芒属植物 叶绿体 InDel标记 育种 应用
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 林业研究
• 页码范围: 153-155,159
• 页数: 4页
• 分类号: Q943.2
• 字数: 3765字
• 语种: 中文

摘要

研究利用芒属植物(芒02381和获04005)叶绿体全基因组测序的结果,开发12对InDel标记.采用正交设计法优化cpInDel-PCR体系,得到模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶5个关键因素在体系中的最佳组合.12对InDel标记对43份芒属和2份甘蔗材料进行扩增,共扩增出538条条带,其中3对引物扩增出13条多态性条带,占总数的2.4％.将所有位点读带转化为数值矩阵并用UPGMA法聚类,在遗传相似系数1.4的水平上,和南获聚为一类,而芒和与五节芒、双药芒、红山茅、尼泊尔芒、甘蔗聚为一类,4个具有杂交种特征的材料单独聚为一类.试验开发的芒属植物cpInDel标记可用于芒与获的区分,指导芒属植物的杂交育种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	易自力	湖南农业大学生物科学技术学院	201	2469	24.0	40.0
2	蒋建雄	湖南农业大学生物科学技术学院	105	1380	20.0	30.0
3	肖亮	湖南农业大学生物科学技术学院	44	296	9.0	14.0
4	薛宏	湖南农业大学生物科学技术学院	32	104	6.0	9.0
6	丁力	湖南农业大学生物科学技术学院	2	8	2.0	2.0
9	彭思佳	湖南农业大学生物科学技术学院	2	5	2.0	2.0