四种常用的生物序列比对软件比较

• 作者: 严志祥 操利超 李玲 陈凤珍
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 下一代高通量测序 比对软件 生物信息
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究快报
• 页码范围: 56-60
• 页数: 5页
• 分类号: Q-31
• 字数: 3210字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2016.01.10

摘要

随着高通量测序技术的快速发展，下一代测序技术也迅速发展为生物领域中的主流技术，而理解下一代测序数据最重要的一步是比对。比对是进行后续生物信息分析的基石，也因此催生了很多比对软件。本文主要选取了四种常用的比对软件Bowtie2、BWA、MAQ和SOAP2，对这四种软件及算法进行综述，并通过实际测序数据对四种软件进行比较和评估，为生物学研究者选择最佳的短序列比对软件提供理论和实践依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈凤珍		3	11	2.0	3.0
2	操利超		3	11	2.0	3.0
3	严志祥		3	11	2.0	3.0
4	李玲		1	8	1.0	1.0