大豆MYB转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析

• 作者: 刘艾林 成舒飞 朱延明 端木慧子 肖佳雷 陈超
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 MYB 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 52-57
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2016.01.0052

摘要

MYB转录因子是植物中最大的转录因子家族之一,近年的研究表明其广泛参与多种生物学过程.MYB转录因子在其N端含有其特有的DNA结合基序(MYB-binding domain),能够与DNA分子大沟结合而调控基因表达.本研究通过生物信息学手段,在全基因组水平上筛选鉴定出了304个大豆MYB类转录因子,并对其进行了分类和保守结构域分析;通过与拟南芥的MYB基因进行系统发生分析,将304个大豆MYB转录因子分为了22个亚类;染色体定位分析表明大豆MYB转录因子在所有染色体上都有分布,部分染色体间的MYB蛋白序列高度相似,表明此类基因在进化上具有相同的来源;利用野生大豆盐、碱胁迫下转录组数据,分析MYB基因的表达模式,发现部分MYB转录因子能够响应盐、碱胁迫的诱导,且在盐、碱胁迫下具有不同的表达模式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱延明	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	125	1696	22.0	34.0
2	刘艾林	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	5	34	4.0	5.0
3	陈超	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	19	120	7.0	10.0
4	肖佳雷	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	13	103	5.0	9.0
5	端木慧子	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	5	43	4.0	5.0
6	成舒飞	东北农业大学农业生物功能基因重点实验室	2	23	2.0	2.0