小麦麦谷蛋白亚基基因密码子用法特性分析

• 作者: 任燕萍 曹兴芹 覃建兵
• 来源期刊: 计算生物学
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 麦谷蛋白亚基 密码子偏爱性
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 页码范围: 18-25
• 页数: 8页
• 分类号: S5

摘要

该文运用CodonW1.4.2和SPSS16.0软件对13个来源于小麦麦谷蛋白亚基基因的密码子用法特性进行分析。结果显示,除1Dy10基因ENC值小于40外,其余亚基基因ENC值均介于40~50之间;GC3含量均在0.38~0.45之间;1Bx14基因偏向于使用A或T结尾的密码子,其余12个亚基基因偏向于使用G或C结尾的密码子;1Dy10与其余12个亚基基因间距离系数较大,然而各组染色体麦谷蛋白x-型或y-型亚基基因间距离系数较小。结果表明,小麦麦谷蛋白亚基基因具有较强的密码子使用偏爱性,各基因密码子用法上具有相似性,每一种氨基酸均存在1~2个偏爱密码子。在密码子用法差异上表现为,除1By9和1Dy10之外,无论是A染色体组、B染色体组,还是D染色体组,各组染色体上麦谷蛋白x-型或y-型亚基基因间密码子使用频率差异最小。这一分析结果对小麦HMW-GS功能基因资源的高效利用和LMW-GS新基因的克隆具有一定的指导意义。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	覃建兵	长江大学生命科学学院	8	11	2.0	3.0
2	任燕萍	新疆农业大学农学院	29	40	4.0	5.0
3	曹兴芹	长江大学计算机学院	2	0	0.0	0.0