致犊牛脑膜炎大肠杆菌新疆分离株ibeB基因的特性分析

• 作者: 倪宏斌 冯广余 凌晨 宋康 师燕霞 张坤 朱玲 王鹏雁 蒋建军
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 脑膜炎 大肠杆菌 ibeB 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 974-982
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20150400

摘要

[目的]分析致犊牛脑膜炎大肠杆菌分离株ibeB基因的分子生物学信息.[方法]以自脑炎死亡犊牛脑组织、肝组织分离鉴定的O 161-K99-STa致病性大肠杆菌牛-EN株和牛-EG分离株为材料.根据GenBank中公布的脑膜炎大肠杆菌K1株RS218 ibeB基因序列设计1对引物,采用PCR方法,从分离株中成功克隆ibeB基因,比较分离株ibeB基因与不同来源大肠杆菌ibeB基因的部分生物信息学特性.[结果]分离株ibeB基因序列全长1500 bp,包含1371 bp开放阅读框,共编码457个氨基酸;生物信息学分析显示,牛-EN株与致人脑膜炎大肠杆菌K1 RS218的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.5％和96.9％,牛-EG株与大肠杆菌K12的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.4％和100.0％;ibeB蛋白为亲水性蛋白,分子质量为50.26 kDa,理论等电点为6.05;该蛋白无跨膜区,但具有信号肽序列;亚细胞定位显示,分泌信号通路位点(SP)占比例为0.939,说明该蛋白属于分泌型蛋白.[结论]从致脑膜炎大肠杆菌分离株中成功克隆ibeB基因,该基因与致人脑膜炎大肠杆菌K1 RS218 ibeB基因有较高的同源性,均有相似的生物学特性,属肠外致病性大肠杆菌.