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猪FUT1基因启动子区的确定及活性分析
猪FUT1基因启动子区的确定及活性分析
作者:
包文斌
吴圣龙
孙寿永
朱国强
王靖
甘丽娜
董文华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
猪
α-(1,2)岩藻糖转移酶1基因(FUT1)
启动子区
CpG岛
摘要:
F18大肠杆菌(Escherichia coli F18,E.coli F18)是养猪(Susscrofa)业中发生最普遍、危害最大的病原菌之一,球系列鞘糖脂生物合成通路及通路中α-(1,2)岩藻糖转移酶1基因(alpha(1,2)fucose transferase 1,FUT1)对断奶仔猪F18抗性具有重要调控作用.本研究运用生物信息学技术挖掘课题组前期获得的断奶仔猪转录组测序结果,确定FUT1基因的转录起始位点和启动子区.同时对启动子区序列进行CpG岛分析;采用双荧光素酶报告基因以及AliBaba 2.0软件,分别分析启动子区活性和CpG岛序列潜在的转录结合位点.通过比对人类(Homo sapiens)和猪的基因序列信息数据库,结果表明,FUT1基因转录起始区域具有5种可变剪接(AS-1,AS-2,AS-3,AS-4和AS-5)和2个启动子区域(启动子1和启动子2);双荧光素酶报告基因检测结果进一步显示,FUT1基因启动子2的转录活性极显著高于启动子1的转录活性(P<0.01),启动子2的活性是启动子1的2.75倍,根据结果可以推测启动子2在转录过程中起主导作用;CpG岛分析显示,猪FUT1基因启动子1和启动子2分别存在一个CpG岛.FUT1启动子1扩增片转录因子预测分析表明,FUT1基因启动子1存在20个潜在的转录因子结合位点,并且Sp1出现在多个转录结合位点处.本研究结果为猪FUT1基因的甲基化检测和调控机制分析提供一定的基础和依据.
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文献信息
篇名
猪FUT1基因启动子区的确定及活性分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
猪
α-(1,2)岩藻糖转移酶1基因(FUT1)
启动子区
CpG岛
年,卷(期)
2016,(2)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
168-175
页数
分类号
S852.2
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2016.02.002
五维指标
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猪
α-(1,2)岩藻糖转移酶1基因(FUT1)
启动子区
CpG岛
研究起点
研究来源
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研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
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农业生物技术学报2016年第6期
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农业生物技术学报2016年第10期
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