Metabarcoding技术在真菌多样性研究中的应用

• 作者: 周蕾 徐海根 曹云 沈文静 胡飞龙 陈炼
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: metabarcoding DNA条形码 真菌多样性保护 物种鉴定 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 932-939
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2016096

摘要

由于受到气候变化、土地利用变化及环境污染等诸多因素的干扰,真菌多样性受到不容忽视的威胁,亟需得到保护.构建物种数据库是实现真菌多样性研究和保护的重要前提.近年来兴起的DNA条形码及metabarcoding 技术能够在很大程度上弥补传统鉴定方法的缺陷,可对真菌物种进行大规模、准确、快速、高效地鉴定.本文梳理了metabarcoding技术在真菌物种多样性评估、真菌多样性影响机制和真菌古生态重建等研究中的应用,同时强调了metabarcoding技术用于真菌多样性研究尚处于初期阶段,在构建有效参照数据库、优化实验流程以及升级生物信息学工具等方面仍需要进一步的完善.建议加强真菌分类学家、生态学家以及计算机工具研发工程师之间的合作,共同解决metabarcoding技术在真菌多样性研究及应用中面临的问题,为宏观尺度上真菌多样性保护提供更加科学的依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈文静	环境保护部南京环境科学研究所国家环境保护生物安全重点实验室	10	46	4.0	6.0
2	曹云	南京大学生命科学学院	2	8	2.0	2.0
6	胡飞龙	环境保护部南京环境科学研究所国家环境保护生物安全重点实验室	3	10	2.0	3.0
7	陈炼	江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院	5	29	3.0	5.0
8	周蕾	南京林业大学林学院	1	4	1.0	1.0