榕小蜂基因共表达研究

• 作者: Robert W.Murphy 何顺民 孙宝发 孙旭斌 崔东亚 张鹏 王佳佳 陈小伟 黄大卫
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 关键词: 共表达 网络 功能富集
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 83-89
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16476/j.pibb.2015.0287

摘要

榕小蜂的雌雄个体之间存在很大表型差异,以至于很难将雌雄个体彼此联系在一起.以对叶榕传粉榕小蜂作为材料,利用“加权基因共表达网络分析”软件(WGCNA),对榕小蜂的基因组和转录组进行分析,结果发现,5个基因共表达模块,分别用蓝色、蓝绿色、棕色、绿色和黄色标识,其中2个模块偏爱在雌蜂中表达,3个模块偏爱在蛹中表达.基因本体(G0)分析发现在蓝绿色和黄色表达模块中发现3个功能富集的基因集合.在蓝绿色基因表达模块中发现2个基因集合,分别与细胞周期和核苷酸结合活性有关;在黄色基因表达模块中发现1个基因结合,与细胞分化有关,尤其是与神经发育有关.