西藏青稞品种藏青13高氮处理的SSH 文库构建及分析

• 作者: 原红军 尼玛扎西 徐齐君 曾兴权 王玉林
• 来源期刊: 大麦与谷类科学
• 关键词: 青稞 高氮处理 SSH EST
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 综述报告
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S512.3
• 语种: 中文

摘要

为了分析青稞高氮处理相关基因的表达，以藏青13为实验材料，通过抑制差减杂交构建了青稞高氮处理下的差减 cD-NA 文库。在随机挑取的281个阳性克隆中，测序获得219条高质量的 EST，含有212条非重复且与 Genbank 中的基因或蛋白具有较高的同源性的序列。对其进行 Blast2Go 功能注释可将差异表达的基因定位到细胞组件、分子功能和代谢过程3大类内。通过 KEGG 代谢途径分析，212个比对结果中的117个 ESTs 有详细的 KO 功能注释，定位到17个具体的代谢途径上，且主要定位在光合作用碳固定途径和氮素代谢途径。此外，分析还发现这些基因主要是编码参与结构和功能代谢合成途径中的一些酶，且参与信号转导、转录调节和光合作用等生理过程，说明这些基因很可能参与到青稞在高氮处理下的抗性反应中。