版纳微型猪近交系 CATSPER3基因克隆、序列及发育 进化分析

• 作者: 刘海京 张秀琼 成文敏 曾养志 查星琴 潘伟荣 王淑燕 王配 肖晶 霍金龙
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 版纳微型猪近交系 CATSPER3基因 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 103-107
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.12.017

摘要

获得版纳微型猪近交系（BMI）CATSPER3基因部分编码区序列，通过生物信息学分析其氨基酸序列和进行不同物种间的同源性比较。以版纳微型猪近交系的公猪睾丸为材料提取 RNA，RT-PCR 方法扩增 CATSPER3基因部分编码区序列，利用在线分析软件进行生物信息学分析。结果显示，扩增出 CATSPER3基因部分编码区序列。生物信息学分析表明，推导氨基酸序列，编码蛋白分子量为19.3973kD，理论等电点为5.05；在氨基酸组成上，酸性氨基酸（Asp+Glu）有24个、碱性氨基酸（Lys+Arg）有16个，其中以亮氨酸（Leu）占13.3%、缬氨酸（Val）占9.6%、苏氨酸（Thr）占9.0%、苯丙氨酸（Phe）占8.4%、谷氨酸（Glu）占7.2%，天冬氨酸（Asp）占7.2%等含量较高。在核苷酸相似度上与普通猪相似度最高，与山羊核苷酸的相似度较低；分子系统进化树表明与非近交系猪同处于一个分支中，亲缘关系较近，与山羊和绵羊亲缘关系较远。