基于核酸DNA/RNA同位素示踪技术的水稻土甲烷氧化微生物研究

• 作者: 贾仲君 郑燕
• 来源期刊: 土壤学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水稻土 好氧甲烷氧化 稳定性同位素示踪DNA/RNA
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 490-501
• 页数: 12页
• 分类号: Q938
• 字数: 8249字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11766/trxb201509020090

摘要

稳定性同位素示踪复杂土壤中微生物DNA/RNA的技术难点是13C-DNA/RNA的鉴定。本研究针对我国六种典型水稻土，利用稳定性同位素13CH4示踪活性的甲烷氧化菌，超高速密度梯度离心获得不同浮力密度DNA/RNA后，以甲烷氧化菌独有的pmoA功能基因和16S rRNA特异基因作为分子标靶，通过半定量凝胶电泳技术评价了特异基因作为分子标靶判定13C- DNA/RNA的可行性，进一步利用克隆文库技术研究水稻土中的活性甲烷氧化菌群落结构。结果表明：甲烷氧化菌功能基因pmoA作为分子标靶，能够准确鉴别13C-DNA，而甲烷氧化菌特异的16S rRNA基因则能较好地区分12C和13C标记的RNA，但13C-RNA中的非目标微生物污染高于13C-DNA示踪技术。进一步以13C-DNA和13C-RNA为模板，分别构建了pmoA和16S rRNA基因的克隆文库，系统发育分析表明I型菌主导了土壤甲烷氧化过程，其中江西鹰潭和黑龙江五常土壤中活性甲烷氧化菌全部属于Ia型，而四川资阳、浙江嘉兴、江苏常熟和江都土壤中Ia型和Ib型甲烷氧化菌均有发现，并且后者比例较低。这些结果表明分子标靶基因能够有效判定复杂土壤中的甲烷氧化菌13C-DNA/RNA，在DNA和RNA水平的结果基本一致，我国典型水稻土中活性甲烷氧化菌可能存在一定的地理分异规律。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑燕	郑州轻工业学院食品与生物工程学院	7	32	3.0	5.0
3	贾仲君	土壤与农业可持续发展国家重点实验室中国科学院南京土壤研究所	2	14	2.0	2.0