不同应激原诱导肝癌SMMC-7721细胞应激反应中相关基因的筛选

• 作者: 张园园 方肇勤 梁超
• 来源期刊: 肿瘤防治研究
• 学科: 医学
• 关键词: 肝癌细胞 应激基因 基因芯片 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 463-467
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3971/j.issn.1000-8578.2016.06.006

摘要

目的 筛选体外培养的肝癌SMMC-7721细胞在抵御不同应激原而恶性增殖的过程中,与应激反应密切相关的基因.方法 常规体外培养肝癌SMMC-7721细胞,将处于对数生长期的细胞分为正常组、G418组和氯化钙组,除正常组外,其余两组分别采用G418、氯化钙加以干预,于72和4h后收集各组肝癌细胞,抽提总RNA,使用GeneAtlas基因芯片系统,制作Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array Strip表达谱芯片,采用iterPlier法计算基因表达读数计算值,并进行统计学处理,观察与肝癌细胞应激反应相关的基因群的差异性表达特征,通过qRT-PCR检测各基因的相对表达量,对芯片结果加以验证.结果 芯片检测筛选到53个表达量大、且在G418和氯化钙作用下表达量变化较一致的基因;qRT-PCR验证的53个应激相关基因中,17个基因与基因芯片结果完全吻合.结论 在肝癌SMMC-7721细胞抵御G418和氯化钙应激的过程中,作用较关键且在基因芯片和qRT-PCR检测中变化趋势较一致的应激相关基因共有17个.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方肇勤	上海中医药大学基础医学院	278	3413	32.0	49.0
2	梁超	上海中医药大学基础医学院	131	251	9.0	12.0
3	张园园	上海中医药大学基础医学院	35	44	4.0	5.0