广西鹅圆环病毒全基因组序列测定

• 作者: 刘棋 孙文超 曹慧慧 苏姣秀 蒙振亩 郑敏 韦显凯 黄宝学
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 鹅圆环病毒 全基因组 序列分析 Rep蛋白 Cap蛋白
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 122-127
• 页数: 6页
• 分类号: S858.33
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2016.01.122

摘要

[目的]解析鹅圆环病毒(Goose Circovirus,GoCV)广西流行毒株的全基因组序列及其遗传进化地位,掌握广西GoCV的流行情况,为今后更有效防控GoCV提供理论依据.[方法]分3段对阳性组织样品中的GoCV全基因组进行PCR扩增、克隆和测序,并对拼接得到的GoCV广西流行毒株全基因组进行核苷酸组成、基因组结构及遗传变异分析.[结果]GoCV广西流行毒株(GXTD254)全基因组长度为1822 nt,编码4个主要开放阅读框:ORFV1(Rep蛋白,293个氨基酸)、ORF V2(37个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,250个氨基酸)和ORF C2(99个氨基酸),且Rep蛋白较Cap蛋白相对保守.遗传进化分析结果表明,GXTD254毒株与4株浙江永康分离毒株(ZJyk1、ZJyk2、ZJyk3和ZJyk4)、1株浙江象山分离毒株(ZJxs1)的遗传距离最接近,同属于一个遗传分支,但与我国台湾的大多数分离毒株(TW1021024G、TWGB21-9、TW6、TW9、TW8和TW1020111GB)及另外2株浙江象山分离毒株(ZJxs3和ZJxs5)的遗传距离较远.[结论]目前我国流行的GoCV存在多个分支,广西流行毒株与部分浙江分离毒株在亲缘关系上比较接近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑敏		33	115	6.0	8.0
2	韦显凯		30	105	5.0	9.0
3	蒙振亩		21	44	3.0	5.0
4	苏姣秀		11	37	4.0	5.0
5	孙文超	广西大学动物科学技术学院	5	26	3.0	5.0
6	曹慧慧	广西大学动物科学技术学院	5	27	3.0	5.0
8	黄宝学		2	17	2.0	2.0