基于线粒体 D-loop 基因的珠江翘嘴鲌遗传多样性与遗传分化研究

• 作者: 刘丽 孙际佳 张鹤千 李桂峰 杨子拓 杨慧荣 肖诗斌 赵会宏
• 来源期刊: 中山大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 珠江流域 翘嘴鲌 D-loop 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 页码范围: 89-96
• 页数: 8页
• 分类号: S932.4
• 字数: 5542字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13471/j.cnki.acta.snus.2016.02.017

摘要

为探明分布于珠江流域的野生翘嘴鲌种群遗传多样性与遗传分化状况，实验在珠江流域广东省（肇庆和韶关）、广西省（梧州、昭平、平乐、柳城、桂平、平果、田阳、龙州和扶绥）自然河流内采集野生翘嘴鲌种群。研究采用线粒体分子标记技术（D-loop 基因）对珠江流域翘嘴鲌种群的遗传多样性做一个多方面的分析。利用 PCR 技术，得到 D-loop 全基因序列856 bp，通过分析发现，176个个体中合计41个单倍型；其单倍型多样性指数（Hd ＝0.87506）和核苷酸多样性指数（π＝0.00700）显示种群具有较高的遗传多样性。11个野生地理群体翘嘴鲌遗传分化指数（FST ）为0.18828，显示珠江流域翘嘴鲌作为一个大种群已产生了中度分化，种群分化时间经计算推断为5万年前左右。其中，梧州和桂平，梧州和肇庆，昭平和平乐，田阳和平果，扶绥和大部分种群（柳城、桂平、田阳、韶关）的遗传分化程度都较低（FST ＜0.05），基因流 Nm ＞5；其他种群两两之间达中度遗传分化（FST ＞0.05），基因流 Nm ＜5。分子系统树和单倍型网络关系显示：单倍型 Hap1和 Hap2可能为单倍型先祖，其余单倍型由其进化而来。但遗传距离与地理距离并没有显著相关性，种群扩散规律需要进一步探索，说明珠江流域野生翘嘴鲌并未地理因素产生种属分化。