夜香树均一化全长cDNA文库的构建及EST分析

• 作者: 何水林 刘涛 吕恃衡 潘东明 郑鸿昌 陈建军 陈桂信
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 夜香树 均一化cDNA文库 EST
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 40-49
• 页数: 10页
• 字数: 8147字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/j.issn.1005-3395.2016.01.006

摘要

为构建高质量的夜香树(Cestrum nocturnum)均一化全长cDNA文库,以其花朵为材料,采用DSN均一化技术与改进的SMART技术相结合,将连接产物进行脱盐浓缩后电转化进行构建.结果表明,未脱盐连接产物的转化效率为1 μL连接产物有7000个菌落,理论重组率为96％;脱盐后,提升为4.1×106个菌落,理论重组率为98％;蓝斑也有插入片段,实际重组率应为100％;插入片段大小平均为1.6 kb.随机挑取500个单克隆(含50个蓝斑)测序,共获得464条EST,单一序列(unigene)为426条,占91.8％,其中片段重叠群26个,单基因400个,冗余率仅为8.1％,表明构建文库的均一化效果较好,可满足后续功能基因的筛选和基因信息的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何水林	福建农林大学作物科学学院	51	436	11.0	19.0
2	潘东明	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	201	1594	19.0	27.0
3	陈桂信	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	59	447	13.0	18.0
4	吕恃衡	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	11	28	3.0	5.0
5	刘涛	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	5	3	1.0	1.0
6	陈建军	福建农林大学园艺产品贮存保鲜研究所	2	6	2.0	2.0