2013年北京市朝阳区柯萨奇A6型病毒分子流行病学研究

• 作者: 姜晓红 李书明 王海滨 赵剑虹 雷娜 韩桃利
• 来源期刊: 首都公共卫生
• 学科: 医学
• 关键词: 手足口病 柯萨奇A6型病毒 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 16-20
• 页数: 5页
• 分类号: R512.5
• 字数: 3539字
• 语种: 中文

摘要

目的 了解2013年北京市朝阳区柯萨奇A6型(Coxsackievirus A6,CVA6)病毒的流行特点及其基因特征.方法 对2013年收集的795份手足口病患者的咽拭子样本进行肠道病毒检测,对非EV71、非CVA16型病毒阳性样本进行CVA6荧光定量PCR检测,选取CVA6阳性样本进行VP1片段(794bp)序列扩增与测序,运用Clustalx软件和MEGA4.0软件对本地区CVA6的VP1片段序列与从NCBI下载的CVA6的VP1参考序列进行聚类分析.结果 肠道病毒通用型核酸阳性样本共计382例(48.1％,382/795),其中非EV71、非CVA16型病毒236例(61.8％,236/382);非EV71、非CVA16型病毒阳性样本中有CVA6型病毒样本185例(78.4％,185/236).基于VP1片段的聚类分析,结果显示2013年该地区的CVA6型病毒与中国地区的参考序列明显聚为一类;CVA6在系统进化树中形成A、B和C等3个基因型,C基因型又可分为C1和C2两个基因亚型;两个基因亚型间的核苷酸序列差异度为10.8％ ～ 13.2％.朝阳区所有的CVA6都位于C基因型,C1亚型包括了大部分该地区序列.结论 2013年该地区的CVA6已经超过了EV71和CVA16,首次成为北京市朝阳区手足口病的主要病原体.该地区存在CVA6的C1和C2两个基因亚型的共循环,其中C1亚型对该地区2013年CVA6的暴发流行起关键作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李书明		40	322	10.0	16.0
2	王海滨		12	78	4.0	8.0
3	姜晓红		11	58	5.0	7.0
4	赵剑虹		11	42	3.0	6.0
5	雷娜		3	35	3.0	3.0
6	韩桃利		1	3	1.0	1.0