犬γ-干扰素基因的克隆、序列分析及蛋白质结构预测

• 作者: 周文树 唐秀华 汪镜 王海荣 蒋成砚 谢昆
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 犬 γ-干扰素基因 克隆 序列分析 蛋白质结构预测
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医?水产养殖
• 页码范围: 170-175
• 页数: 6页
• 分类号: S858.292
• 字数: 3332字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2016.01.026

摘要

根据GenBank上犬γ?干扰素基因（IFN?γ）序列（序列号WO318193），利用Primer 5．0软件设计特异性引物，应用RT?PCR技术从100μg／ml ConA刺激24 h后的犬外周血淋巴细胞总RNA中扩增出γ?干扰素基因，测序后应用DNAStar软件对克隆的犬γ?干扰素基因进行序列分析，并与GenBank上发表的犬、牛、大熊猫、鸡、牦牛、人、猪、野猪、斑马鱼、土拨鼠等的IFN?γ基因序列进行同源性比较。结果显示，克隆的犬IFN?γ基因大小501 bp，编码166个氨基酸，与犬、牛、大熊猫、鸡、牦牛、人、猪、野猪、斑马鱼、土拨鼠 IFN?γ基因的核苷酸序列同源性分别为98?4％、81?6％、26?1％、26?1％、22?7％、22?7％、80?8％、81?0％、28?5％和25?0％；氨基酸序列同源性分别为95?8％、72?5％、5?4％、5?4％、6?6％、6?6％、68?9％、69?5％、5?4％和5?4％。运用DNAstar软件对犬γ－干扰素进行蛋白结构预测的结果显示，犬γ?干扰素蛋白含有10个α?螺旋、9个β?折叠、11个β?转角和5个无规则卷曲。