沙田柚β-D-木糖苷酶基因的鉴定及序列分析

• 作者: 刘玉洁 李惠敏 秦新民 覃信梅 郭丹妮 韩愈
• 来源期刊: 林业世界
• 学科: 农学
• 关键词: 沙田柚 β-D-木糖苷酶基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 102-110
• 页数: 9页
• 分类号: S6

摘要

从沙田柚自交和异交花柱转录组测序中鉴定了β-D-木糖苷酶基因序列。该基因全长为2647 bp (GenBank登录号为KU925841),开放阅读框(ORF)为2385 bp,共编码794个氨基酸,编码的蛋白质的分子量为87.30 kDa,理论等电点为5.87。β-D-木糖苷酶基因编码蛋白为亲水性蛋白,含有1个与糖基水解酶家族蛋白相同的保守CAS结构域。β-D-木糖苷酶基因在沙田柚在未授粉花柱中的表达量(RPKM)为0.07,自花授粉1、2、3 d花柱中的表达量(RPKM)分别为43.13、27.84、1.95,在异花授粉1、2、3 d花柱中基因的表达量(RPKM)则分别为33.90、76.14和49.63。系统进化树显示沙田柚β-D-木糖苷酶与甜橙(Citrus sinensis, XM_006468131)和克莱门柚(Citrus clementina, XM_006449591)亲缘关系很近,属于同一进化分支。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
3	韩愈	广西师范大学生命科学学院	5	7	1.0	2.0
4	刘玉洁	广西师范大学生命科学学院	3	11	1.0	3.0
5	郭丹妮	广西师范大学生命科学学院	3	11	1.0	3.0
6	覃信梅	广西师范大学生命科学学院	3	2	1.0	1.0