甘蓝型油菜低温诱导下的bZIP转录因子挖掘及聚类分析

• 作者: 傅廷栋 刘春晴 咸拴狮 李萌 杜春芳 涂金星 胡恺宁 范建春
• 来源期刊: 植物遗传资源学报
• 关键词: 甘蓝型油菜 低温 bZIP转录因子 挖掘 聚类分析
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 基因挖掘
• 页码范围: 153-161
• 语种: 中文
• DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.2016.01.023

摘要

植物响应低温胁迫的过程是一个复杂的网络过程,涉及众多转录因子的调控.本文通过对低温胁迫下的甘蓝型油菜转录组数据进行生物信息学分析,获得108个序列编码bZIP转录因子.经过序列比对、染色体定位和聚类分析,发现这些转录因子定位在19条染色体上,在抗寒过程中表现动态变化;同时发现这些转录因子在A亚族、C亚族、I亚族、G亚族、S亚族中聚集最多,B亚族和D亚族中很少聚集;取4个在所有胁迫阶段皆表现差异的基因进行定量分析,发现其调控变化与测序分析的变化趋势相同,不仅证明了测序数据的可靠性,而且证明甘蓝型油菜bZIP转录因子对低温胁迫的响应是一个动态的调控过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	傅廷栋		101	4070	37.0	61.0
2	咸拴狮	山西省农业科学院棉花研究所	16	64	5.0	7.0
3	杜春芳	山西省农业科学院棉花研究所	21	118	5.0	10.0
5	涂金星	华中农业大学植物科学技术学院	41	1328	21.0	36.0
6	范建春	山西省农业科学院棉花研究所	15	29	3.0	4.0
9	刘春晴	华中农业大学植物科学技术学院	1	6	1.0	1.0
10	胡恺宁	华中农业大学植物科学技术学院	2	6	1.0	2.0
11	李萌	山西省农业科学院棉花研究所	4	9	2.0	3.0