玫烟色棒束孢诱导的小菜蛾免疫响应表达谱分析

• 作者: 何余容 吕利华 谢梅琼 雷妍圆 顾家睿
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 小菜蛾 玫烟色棒束孢 免疫应答 转录组 RNA-seq 表达谱 生物信息学
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 病理
• 页码范围: 956-964
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2016.09.005

摘要

[目的]本研究旨在筛选小菜蛾Plutella xylostella应对玫烟色棒束孢Isaria fumosorosea侵染的免疫应答及其网络调控基因,以进一步探讨小菜蛾对玫烟色棒束孢的防御机制.[方法]采用第二代高通量测序技术RNA-seq,对处理后12h的感染玫烟色棒束孢和健康(平行对照)的小菜蛾4龄幼虫转录组进行了测序,通过生物信息学分析对得到的差异基因进行了功能注释和分类,对差异基因参与的信号通路进行了分析.[结果]在感菌和健康小菜蛾幼虫转录组两个表达谱里,分别获得了12 346 987和12 315 210个clean reads,有60.93％和61.26％的reads分别能比对到参考基因库里,其中完美匹配(perfect match)的比例分别为32.15％和32.73％.共得到351个显著差异表达基因(differentially expressed unigenes,DEUs),上调表达基因有275个,下调表达基因有76个,与免疫防御反应潜在相关的基因有156个.GO(Gene Ontology)富集分析有102个DEUs分布到46个GO term里,KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) pathway富集分析结果显示,有132个DEUs显著富集在13个代谢通路(pathway)里.[结论]这些差异表达基因中,大部分编码潜在的与免疫识别及调控相关的基因,集中在能量代谢、疾病反应和防御反应等相关通路.研究结果为挖掘与玫烟色棒束孢侵染相关的小菜蛾免疫应答候选基因提供了重要数据库,也为阐明小菜蛾对玫烟色棒束孢的免疫机制奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕利华	广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室	71	1188	19.0	30.0
2	何余容	华南农业大学农学院	97	1200	19.0	28.0
3	雷妍圆	广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室	5	10	3.0	3.0
4	谢梅琼		1	3	1.0	1.0
5	顾家睿	华南农业大学农学院	1	3	1.0	1.0