几个常用内参基因在淀粉酶产色链霉菌1628抗药性突变株中稳定性的评估

• 作者: 俞晓平 姚佳忆 汤谷 申屠旭萍
• 来源期刊: 中国生物防治学报
• 学科: 农学
• 关键词: 淀粉酶产色链霉菌 荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 518-523
• 分类号: S476
• 语种: 中文
• DOI: 10.16409/j.cnki.2095-039x.2016.04.014

摘要

淀粉酶产色链霉菌Streptomyces diastatochromogenes 1628是一株重要的生防菌株,其代谢产物对多种植物病原真菌具有较强的抑制效果.为了筛选在其不同抗药性高产突变株中均能稳定表达的内参基因,选择16S rRNA、sigB、hrdB、thyA、gyrB和rpoA共6个常见内参基因,分别探究它们在野生型菌株、链霉素抗性突变株、利福平抗性突变株和巴龙霉素抗性突变株中的表达情况,并用geNorm软件和NormFinder软件对结果进行分析.结果表明,使用不同软件分析得出的最佳内参基因略有差异.geNorm软件认为在上述4株菌株中,表达最稳定的内参基因分别是gyrB、gyrB、thyA、rpoA;而NormFinder软件认为rpoA基因在所有菌株的表达都是最稳定的.利用平均等级的算法平衡两个软件的分析差异,最终确定rpoA基因为表达最稳定的内参基因.通过检测toyG基因的表达水平,发现以rpoA作为内参基因能得到更合理的结果.