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陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
作者:
张香桂
徐珍珍
徐鹏
杨阳
沈新莲
蔡继鸿
郭琪
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
陆地棉
耐盐
转录组
EST-SSR标记
EST-InDel标记
差异表达基因
摘要:
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究.本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析.获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及InDel等分子标记;随机选择了部分SSR及InDel引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性.本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性.
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EST
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内容分析
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内容分析
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文献信息
篇名
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
来源期刊
棉花学报
学科
农学
关键词
陆地棉
耐盐
转录组
EST-SSR标记
EST-InDel标记
差异表达基因
年,卷(期)
2016,(1)
所属期刊栏目
研究与进展
研究方向
页码范围
65-74
页数
10页
分类号
S562.035
字数
6153字
语种
中文
DOI
10.11963/issn.1002-7807.201601008
五维指标
传播情况
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节点文献
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耐盐
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EST-SSR标记
EST-InDel标记
差异表达基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
棉花学报
主办单位:
中国农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1002-7807
CN:
41-1163/S
开本:
大16开
出版地:
河南省安阳市开发区黄河大道西段中棉所办公区
邮发代号:
33-63
创刊时间:
1974
语种:
chi
出版文献量(篇)
2011
总下载数(次)
0
总被引数(次)
29538
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