光诱导香菇菌丝转色阶段的转录因子表达分析

• 作者: 万佳宁 唐利华 李燕 王莹 谭琦 鲍大鹏
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 香菇 转色 光线 转录因子 高通量测序
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1106-1116
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.150162

摘要

转录因子在真菌环境响应及生理过程中发挥重要的调节作用.本文利用转录组测序(RNA-Seq)技术研究光诱导香菇菌丝转色过程中的转录因子表达变化.转录组测序结果表明,在光照条件下转色的菌丝(313C)与黑暗条件下未转色的菌丝(313W)相比,香菇菌丝中共有68个转录因子基因表达发生变化(48个转录因子上调表达,20个转录因子下调表达);转色的菌丝(313C)与初始未转色的菌丝(118)相比,香菇菌丝中有80个转录因子基因表达发生变化(49个转录因子上调表达,31个转录因子下调表达).这些差异表达的转录因子包括WD40、MADS-box、MYB和GATA等家族.另外,样品的两两比较中差异表达的转录因子既存在部分重叠,也表现特异性.其中,313C/313W中有14个特异性差异表达转录因子,313C/118中有26个特异差异表达的转录因子.重叠的转录因子有64个,其中有39个表达水平上调,15个表达水平下调.采用实时荧光定量PCR对几个转录因子进行了表达检测,其中部分转录因子的表达趋势与转录组分析基本相同.这些数据为进一步研究香菇转色的转录调控奠定了一定的基础.